無刷直流電動機可以像有刷直流電動機那樣以電源的接通或斷開來實現啟停控制。這種控制方法通常是用有觸點開關直接完成。這種方法的缺點是起動電流比較大，電流過大容易引起過熱和去磁問題，起動過快還會引起負載機械的沖擊，所以只適應于小功率電動機。 更常用的方法是用有觸點開關接通控制器電源后，再通過對控制器的控制實現起動和停止，例如： 在控制器設置有啟停控制口（使能控制），以邏輯電平來控制電動機的起動和停轉。 有調速功能的的控制器，以轉速控制指令電壓的高低控制電動機轉速，常常取電壓為零時電動機停轉。有些控制器有PWM信號接口，該信號占空比為零時電動機停轉。 采用通/斷位置傳感器激勵電源的方法。 　　無刷直流電動機最好采用具有軟起動功能的控制器，以降低電動機起動時過大的電流沖擊，轉速能夠平穩上升，減小轉速的過沖，并以較短時間到達預定轉速。常見的軟起動是采用PWM方法。軟起動驅動器通常使脈寬調制占空比從零開始上升，慢慢增加到較大，直至預定轉速。然后，控制系統才轉換到正常位置、速度或轉矩（電流）閉環控制。緩慢提升PWM占空比相當于緩慢增加施加于電動機的電壓，從而使起動電流限制到一個合適的水平。一般來說，５０至幾百毫秒的軟起動斜坡足以限制電流沖擊。然而，有些大轉動慣量電動機起動時軟起動斜坡需要更長時間。