蘑菇渣作為栽培基質須有適宜的理化性質，易分解的有機物大部分分解，施入土壤后不產生氮的生物固定，通過降解除去酚類有害物質，消滅病原菌、病蟲卵和雜草種子。因此，菇渣須經特定工藝處理，方可作為栽培基質使用。通常采用好氧堆肥法，利用微生物菌劑發酵作用，即高溫堆肥發酵，將菇渣與填充料按一定的比例混合，在合適的水分、通氣條件下，使微生物繁殖并降解有機質，從而產生高溫，殺死其中的病原菌及雜草種子，使有機物達到穩定狀態。將輔料（含發酵微生物、尿素、芝麻渣）混合，加入清水攪拌均勻，用水泵向菇渣堆均勻噴灑，翻堆混合，直到含水量在50%左右，用手緊抓，指縫有水滲出，覆膜發酵。溫度升高后，經常翻堆，使內外發酵均勻，保證溫度在65℃以下。大概3個月時間，檢查菇渣堆料顏色，發酵前堆料呈淺黃色，發酵后呈黑褐色，發酵前堆料有新鮮蘑菇味。也可用電導率（EC）來判斷，一般發酵前EC較低，發酵過程中，逐漸增高。

發酵蘑菇渣做有機肥料一般我們選擇微生物發酵劑，利用有益微生物菌間的相互吞噬作用，消滅蘑菇渣里面的有害病菌，快速發酵，縮短腐熟發酵時間，蘑菇渣配合豬糞，雞糞等動物糞便，制作成生物菌肥，成本低，肥效好。
啟富菌肥發酵劑是專門發酵生物菌肥的發酵劑，可以發酵各種蘑菇渣，菌渣，菌棒。
名稱：菌肥發酵劑菌液-蘑菇渣發酵劑
規格：每瓶1000ml一箱12瓶裝
性狀：紅褐色液體
用量：一箱可以發酵2.5-3噸菌渣
發酵物料：蘑菇渣、金針菇廢棄料、平菇菌渣、蘑菇菌棒等所有菇類種植后的下腳料
使用方法：本品為一代原液，無需在進行加工配置，可以直接使用，操作方便，簡單。